日本語表示できない問題 Matplotlibでは、日本語を扱えるフォントが指定されていない場合に日本語を含んだプロットを出力すると、文字化け（◻︎）が表示されてしまいます。 plt.figure() plt.title("てすと") 日本語フォントをダウンロード 日本語を表示する…

以前の記事ではざっくり無料で学べるバイオインフォマティクス関連コンテンツに関してご紹介しました。 www.kimoton.com その中でも特にオススメなのが今回紹介するRosalindです。 競技プログラミング！？と書きましたが、形式が競プロ（課題を解き答えをsub…

Galaxyとは Galaxyは、プログラミングに長けていないユーザーでもバイオインフォマティクス解析のパイプラインを構築できるように作られたOSS（Academic Free License）です。世界中のユーザーから構成されるコミュニティによって維持されており、ヘルプペー…

先日Courseraを紹介しましたが、courseraのコースはフリーではないのでは？とコメントを頂きました。 修了証付きの専門講座に関してはご指摘の通り、有料となっています。一方で、単一のコースを閲覧する分には無料で受けることができるので、その手順をご紹…

最近バイオインフォマティクスを学びたいという方によく巡り合う気がします。 私kimoton、バイオインフォマティクスと名の付く書籍は多数読み漁ってまいりました。そんな経験を活かし、今回は無料かつオンライン上で利用できるコンテンツに絞ってご紹介させ…

つい数年前までは、「DNA検査」と言うと父子鑑定を思い浮かべる方がほとんどでしたが、最近では日本でもDeNAのMyCodeやGenesis HealthcareのGeneLife、高橋祥子社長で有名なGene Questなど、様々な個人向け遺伝子検査サービスが出てきており、その認識が変わ…

ここまでで紹介してきた生存関数の推定やハザード関数の推定、ログランク検定といったノンパラメトリックな手法は、一標本の生存時間データ解析、二群間の比較に有用な方法になります。 一方で、実際の医学研究では、個々の被験者について、生存・死亡といっ…