2020/02/21 カラム名の中央揃え追記 -- こんな検索ワードで検索したあなたが引っかかってくれると信じて。 option description -i indexファイル名 -o outputファイル名 -b ブートストラップの回数 --single single-end の場合、付ける。 -l 平均のフラグメ…

バイオインフォで扱うデータってcolumnが多い場合が多々あります。 例えば、10X Genomicsの公開データ（bam）をsamtoolsで見てみると。 kimoton@DESKTOP-BL78EM7:~$ samtools view http://s3-us-west-2.amazonaws.com/10x.files/samples/cell-exp/2.1.0/pbmc…

きっかけ 最近のRパッケージ（今回はsinglecell解析に使うパッケージ）がR 3.5.0でないと動かない。。 Bioconductor - SingleCellExperiment (development version) R 3.5.0入れたdocker imageを動かそうとも考えたけど、データのマウントとか面倒そう。。 W…

An Interface to Google Drive • googledriveを使ってみた 特徴 ほとんどの関数はdrive_で始まっているおかげでgoogledriveパッケージの関数を自動補完で呼び出しやすい。 find, ls, mv, cp, mkdir, rmといったUINIXコマンドを打つようにgoogleドライブを操…

An Interface to Google Drive • googledriveこれ使ってgoogledriveをコマンドからいじれるようにしたかったのにそもそもWSL内にgoogle-chromeが入ってなかった。 google-chromeをインストール google-chromeをインストールします。 署名鍵のダウンロード、…