SAM/BAM

Pythonでバイオインフォマティクス - BAM/SAMファイルを扱う

インストール手順は大抵conda かpipで可能なので、これらをいちいち紹介しても仕方ない気がしてきました。今回からインストール部分は省いてご紹介します。 前回の記事ではアライメント情報を格納するためのフォーマット、BAM/SAMファイルをご紹介しました。…

SAM/BAMフォーマットは10年モノだっていう話

SAM/BAMといえばアライメントデータを格納するためのフォーマットとして一般的に使用されていますが、そもそもこのフォーマットはどういう経緯で生まれたのでしょう。 開発者であるHeng Li氏のブログにてその話があったため、読んでみました。サクッと読めま…