VCF

pythonでバイオインフォマティクス - VCFファイルを扱う

GATKやSAMtoolsなどの変異解析ツールを実行した際に、含まれていた一塩基変異(SNP)、挿入(Insert)、欠失(Deletion)等の情報はVCFファイルというフォーマットで出力されます。 VCFファイルのフォーマットに関しては、GATKの説明ページを参照してくださ…