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2018-02-09から1日間の記事一覧

2018-02-09

bamファイルがpaired end かsingle end なのかを調べる

Rsamtools を使った判定法 > packageVersion("Rsamtools") [1] ‘1.20.5’ library(Rsamtools) # ファイルのPATHを指定 fl <- system.file("extdata", "ex1.bam", package="Rsamtools") > quickBamFlagSummary(fl) group | nb of | nb of | mean / max of | re…

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